Dec, 2023

XAI 与生物学的结合:可解释人工智能在生物信息学应用中的综述

TL;DR人工智能特别是机器学习和深度学习模型对生物信息学研究产生了重大影响,但这些模型的可解释性和透明度不足在深入的生物学见解和生成可检验的假设方面存在挑战。可解释人工智能 (XAI) 已经成为增强生物信息学中人工智能模型的透明性和可解释性的有希望的解决方案。本综述详细分析了各种 XAI 技术及其在 DNA、RNA 和蛋白质序列分析、结构分析、基因表达和基因组分析以及生物成像分析等各种生物信息学领域中的应用。我们介绍了最相关的机器学习和 XAI 方法,然后讨论了它们的多样应用并解决了现有 XAI 工具的当前限制。通过提供对 XAI 的潜力和挑战的见解,本综述旨在促进其在生物信息学研究中的实际应用,并帮助研究人员探索 XAI 工具的领域。