Mar, 2024

3D-TransUNet 在 BraTS2023 挑战中用于脑转移灶分割

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TL;DR通过在 Brain Tumor Segmentation (BraTS-METS) 2023 challenge 数据集上训练 3D-TransUNet 模型，我们探索了两种架构配置：仅在编码器中使用 Transformer 的 Encoder-only 3D-TransUNet 和仅在解码器中使用 Transformer 的 Decoder-only 3D-TransUNet 模型，结果显示 Decoder-only 3D-TransUNet 模型在脑转移分割方面具有增强的效果。
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发现论文，激发创造
  • 基于 Transformer 的多模态脑肿瘤分割

    本文提出了使用 Transformer 和 3D CNN 实现 MRI 脑肿瘤分割的新网络 TransBTS。该网络同时利用全局和局部特征进行分割，并在 BraTS 2019 和 2020 数据集上取得了当前最高水平的分割效果。

    Mar, 2021

  • 基于残差变换器的脑肿瘤分割的集成学习

    提出了一种将 Transformers 集成到自适应 U-Net 中的新型网络架构，以合理的计算成本提取出三维体积上下文，并探索集成方法，证明了组合多个架构以优化脑肿瘤分割的潜力。

    Jul, 2023

  • 3D TransUNet：通过视觉 Transformer 提升医学图像分割

    通过在 2D TransUNet 体系结构的基础上建立在最先进 nnU-Net 体系结构的基础上，充分探索 Transformers 在编码器和解码器设计中的潜力，我们引入了两个关键组件：1）一个从卷积神经网络（CNN）特征图中令图像块标记化的 Transformer 编码器，从而实现全局上下文的提取；2）一个自适应地利用候选区域和 U-Net 特征之间的交叉注意力进行候选区域的精炼的 Transformer 解码器。我们的研究发现，不同的医学任务受益于不同的体系结构设计。Transformer 编码器在多器官分割中表现出色，其中器官之间的关系至关重要。另一方面，Transformer 解码器在处理小而具有挑战性的分割目标（如肿瘤分割）方面更有益处。大量实验证明了将基于 Transformer 的编码器和解码器集成到 U 型医学图像分割体系结构中的巨大潜力。TransUNet 在各种医学应用中超越竞争对手。

    Oct, 2023

  • 混合多头关注式三维 Unet 用于脑肿瘤分割

    提出了一种新颖的混合多头注意力 U-Net 架构，用于准确的脑肿瘤分割，并捕捉复杂的空间关系和微妙的肿瘤边界。与 SegNet、FCN-8s 和 Dense121 U-Net 架构相比，该模型在评估性能指标方面表现出色。

    May, 2024

  • Swin UNETR: 基于 Swin Transformers 的 MRI 图像脑瘤语义分割

    利用 Swint UNEt TRansformers 模型和多模 MRI 数据对 3D 颅脑肿瘤进行语义分割，可以转换为序列预测问题，以 5 个不同分辨率提取特征，通过跳过连接连接到 FCNN 解码器，并在 BraTS 2021 分割挑战中表现出优越的性能。

    Jan, 2022

  • 注意力增强的混合特征聚合网络用于三维脑肿瘤分割

    基于多尺度关注引导 U-Net 模型以及 Swin Transformer 的三维脑肿瘤分割方法的性能评估。

    Mar, 2024

  • 脑肿瘤分割的处理和迁移学习的优化框架

    基于 3D U-Net 模型的多模态脑肿瘤分割框架在验证数据集上实现了 Challenges 1、2 和 3 分别为 0.79、0.72、0.74 的平均病灶 Dice 分数。

    Feb, 2024

  • nnU-Net 用于脑肿瘤分割

    本文通过对 nnU-Net 模型进行 BraTS 2020 挑战的分割任务，在后处理、基于区域的训练、更激进的数据增强以及对 nnUNet 管道的一些小修改方面，结合 BraTS 特定的修改，大大提高了其分割性能。在重新实现 BraTS 排名方案以确定我们的 nnU-Net 变体中最符合其要求的方案的同时，我们的最终集成在整个肿瘤中，肿瘤核心和增强肿瘤方面的 Dice 分数分别为 88.95、85.06 和 82.03，HD95 值分别为 8.498、17.337 和 17.805 获得了 BraTS 2020 比赛的第一名。

    Nov, 2020

  • 基于集成方法的成年脑肿瘤自动分割：利用 BraTS AFRICA 挑战数据的新方法

    应用深度学习于亚撒哈拉地区患者的多模态磁共振成像数据，以提高脑肿瘤分割的精确度，研究表明集成方法可以优于单一模型，在评估指标上展现出 0.82、0.82 和 0.87 的 Dice 评分，为精确分割脑肿瘤奠定了基础，并为未来的研究和性能评估提供了参考。

    Aug, 2023

  • 使用基于 3D 注意力机制的 U-Net 进行多类 MRI 脑肿瘤分割

    本文提出了一种基于 3D 注意力的 U-Net 架构，用于使用由三个非本地 MRI 卷积组合而成的单一堆叠的多模态体积进行大脑肿瘤的多区域分割。该方法通过在 U-Net 的解码器端添加注意机制来提高分割精度，从而减少了对健康组织的侧重和突出了恶性组织，提高了泛化能力并减少了计算资源。该方法在 BraTS 2021 任务 1 数据集上进行训练和评估，证明其在精度上优于其他方法。实验结果表明，该方法潜在地提高了使用多模态 MRI 数据进行大脑肿瘤分割的能力，有望为更好地理解和诊断脑部疾病做出贡献。这项工作强调了在大脑肿瘤分割中结合多种成像模式和引入注意机制以提高精度的重要性。

    May, 2023