多尺度异质性感知的组织病理学全切片图像超图表征
我们提出了一种新的基于异构图的框架,利用细胞核的不同类型之间的相互关系进行 WSI 分析。通过将 WSI 建模为一个具有 “核型” 属性和语义相似性属性的异构图,采用新的异构图边属性转换器 (HEAT) 和基于伪标签的语义一致汇聚机制来获得图层特征,并采用因果驱动的方法来解决现有关联定位方法的局限性。大量实验证明,在各种任务上,我们的框架相比于现有方法具有显著的优势。
Jul, 2023
基于多模态融合模型,结合病理图像和基因组数据,本文提出一种适用于癌症生存分析的病理基因异质图模型(PGHG)。通过生物学先验知识,该模型实现了特征提取、生存预测和可解释性展示等功能,并在多个癌症数据集上证明了其性能优越性。
Apr, 2024
本研究提出了一种 Patch-GCN 算法,该算法可以对肿瘤微环境中的局部和全局拓扑结构进行建模,从而对患者的生存预后进行更好的预测。该算法通过 4,370 张 WSIs 的验证,在 5 种不同的癌症类型中,表现出比之前研究中所有的弱监督方法都要好。
Jul, 2021
提出了一种名为 HVTSurv 的分层视觉 Transformer 框架,可对全切片图像进行预测和患者级别的癌症预测,并通过 3,104 名患者和 3,752 个全切片图像的验证实现了比以前的弱监督方法更高的平均 C 指数。
Jun, 2023
此研究提出了一种名为 DeepAttnMISL 的多实例深度学习方法,通过引入两种方式(siamese MI-FCN 和 attention-based MIL pooling)从 WSI 中高效地学习图像特征,然后将 WSI 级别的信息聚合到患者级别。该方法适用于大型数据集,并具有更好的可解释性,可用于癌症患者风险评估和个性化医疗。
Sep, 2020
应用深度学习技术分析组织病理图片对于自动预后预测的重要性进行了创新性研究,提出了一个新颖的三部分框架,包括基于卷积网络的组织分割算法、对比学习模块和嵌套多示例学习分类模块。在人工生成的数据和简单的诊断任务上进行了初步验证,并在膀胱癌的预后预测任务中取得了显著的成果,模型的 AUC 分别达到 0.721 和 0.678。
May, 2024
本研究提出一种基于多层次组成的组织表征模型来对癌症进行诊断、预测、治疗,并采用基于图的神经网络来学习和识别多层次组成的多组织结构。我们还介绍了 BReAst 癌症亚型识别数据集,并通过比较研究和消融研究证实了我们的方法优于其他方法和病理学家。
Feb, 2021
我们提出了一个自动预测肠癌患者结直肠癌肝转移的病理预后的端到端方法,利用 H&E 和 HPS 染色的组织学切片;我们使用生成对抗网络对切片进行标准化,采用半监督模型进行组织分类,使用注意力机制加权不同区域进行分类,训练预后模型并在 258 名患者上进行了评估,结果证明我们的方法在预测生存和治疗时间反应方面具有优越性,可推动精准医学在管理结直肠癌肝转移患者中的进展。
Nov, 2023
本文提出了一种弱监督整个切片图像分割的框架,利用标准的临床注释,采用多实例学习方案进行模型训练,并在 The Cancer Genome Atlas 和 PatchCamelyon 数据集上进行了评估,显示出一定的潜力.
Apr, 2020