May, 2024

基于最小描述长度原理的网络重建

TL;DR从动态或行为数据中重建网络的一个基本问题在于以能够防止过拟合的方式确定最适合的模型复杂度,并生成具有统计合理边数的推断网络。与常见做法 L1 正则化结合交叉验证相比,本文提出了一种基于层级贝叶斯推断和权重量化的非参数正则化方法,该方法能够提高网络重建的准确性,并且不需要事先知道边的数量。特别是在关于大规模物种数量的微生物群落间相互作用网络重建方面,我们展示了该方法的应用,并演示了利用推断模型预测系统干预结果的能力。