利用组织病理学特征提取器进行全片幅图像生存分析
通过系统地研究 WSIs 分类算法的不同设计选择,我们发现全局上下文信息并非越多越好,而是以局部小区域的细节信息为主要特征,此外,相较于在更大的数据集上进行无监督预训练,我们发现在更小、更专注的数据集上进行预训练可以更好地区分输入补丁的微妙差异。
Oct, 2023
基于 BROW 模型,我们提出了一种用于提取 WSI 特征表示的基础模型,通过使用自蒸馏框架预训练的转换器结构,改进模型的鲁棒性,并利用 WSI 的多尺度金字塔来增强其性能,我们在各种器官和组织的 WSI 上进行实验,证实了该模型的有效性、鲁棒性和良好的泛化能力,从而突出了其在 WSI 处理中的潜力和应用前景。
Sep, 2023
数字病理学通过对 G 级全幅图像(WSI)的分析大大提高了疾病检测和病理学家的效率。我们的研究揭示了特征提取模型和聚合模型超参数之间的相互依赖性,指出选择的超参数可能会使性能可比性产生偏差。通过对 162 个不同聚合模型配置的三个不同数据集上的七个特征提取模型的评估,我们提供了关于特征提取器和聚合模型之间关系的更细致的理解,从而使数字病理学中的特征提取模型能够获得更公正和准确的评估。
Nov, 2023
深度学习在病理学中的应用包括疾病预测和个体化治疗,研究表明,在计算机病理学中,传统的染色归一化处理在深度学习时代仍然存在争议,采用以自我监督学习训练的特征提取器可以在省内存和计算资源的同时不影响下游性能,同时对染色和图像扩增具有鲁棒性。
Nov, 2023
本论文提出了一种新的模型结构,将基于补丁的分类模型和整个切片比例的分割模型相结合,以提高自动病理诊断的预测性能,并通过优化方法,使模型部分地进行端到端学习,应用于 WSI 的肿瘤 / 正常预测,与传统基于补丁的方法相比,分类的性能得到了提高。
Oct, 2019
通过弱监督的多实例学习方法,利用全幅显微镜图像整体癌症表型的预测来探索肿瘤检测和癌基因突变检测,结果显示与参考实现(AUC 0.96)相匹配的新型叠加多实例学习和关注多实例学习(AUC 0.97)对肿瘤和 TP53 突变的检测能力优于其他 AI 架构,并在不同放大级别下显示对形态特征的不同敏感性。
Apr, 2024
该论文研究了域特定预训练模型对神经胶质母细胞瘤分类的影响和应用性,通过考虑目前最先进的多实例学习模型,CLAM 和 TransMIL,并评估模型的置信度和预测性能,表明域特定预训练有助于提高模型置信度并实现 WSI 基础的神经胶质母细胞瘤亚型分类的最新最佳性能。
Feb, 2023
提出一种基于相互 Transformer 学习的全无监督 WSI 分类算法,并在公开数据集上进行了广泛实验,证明了该方法在 WSI 分类和癌症亚型分类方面的优越性能。
May, 2023
本文介绍了一种基于图神经网络和 DenseNet 的方法,使用颜色选择和生成的样本 patches 并保持图像信息的关联性,以对肺癌的亚型进行精确分类。模型在 The Cancer Genome Atlas 数据集上表现出了 88.8% 的准确率和 0.89 的 AUC。
Apr, 2020