基于知识的药物样本比较
本文介绍了一个药品匹配及数据整合技术,包括一个基于朴素贝叶斯分类器的系统,可实现 98.3% 药品匹配精度、99.2% 的精度和 97.5% 的召回率。
Jul, 2022
通过知识图谱中的生物医学领域信息,使用深度学习技术和图神经网络,基于药物的图表示,预测和解释药物之间的潜在相互作用,以弥补已知药物之间相互作用稀缺性的不足,在药物交互作用预测中取得了领先的性能,促进了生物医学和医疗保健的发展。
Nov, 2023
设计了一个基于患者和药物特征的全面药物推荐系统,将数据从多个数据库中整合为一个患者和药物信息的数据集,其中使用了人工智能模型、自然语言处理方法和推荐系统算法进行数据建模,通过药物相互作用、患者条件和药物特征生成了基于矩阵分解的模型,构建了基于规则的知识库系统。
Dec, 2022
该论文介绍了一种名为 medicX 的端到端框架,它将来自公共药物库的多种药物特征集成到一个知识图谱中,并使用各种翻译、分解和神经网络方法嵌入图谱中的节点,最终使用机器学习算法来预测未知的药物相互作用。
Aug, 2023
本文研究使用 GPT-2 等较小的语言模型获取比较知识的任务,提出一种新的比较知识提取框架 NeuroComparatives,并通过对所获得的 8.7M 个关系的人类验证,证明其优于现有资源(包括 GPT-3),这一结果表明适用于较小语言模型的神经符号操作是目前主流极大规模语言模型应用范围受限的一种有效的替代方案。
May, 2023
本文提出了一种新的基于多数据源知识图谱嵌入的机器学习方法,用于预测药物相互作用的风险,融合了 DrugBank、PharmGKB 和 KEGG drug 三个数据库中的 12,000 个药物属性信息进行训练,并采用 ComplEx 嵌入方法、Convolutional-LSTM 神经网络和机器学习模型来实现,通过三个最佳分类器的模型平均集成方法,在 5 折交叉验证测试中得到的平均精度、F1-score 和 MCC 值分别为 0.94、0.92、0.80。
Aug, 2019
本文介绍一种基于知识图谱架构的计算方法,用于发现天然植物产品和药品共同消费时的药代动力学自然产物 - 药物相互作用 (NPDIs),并且以绿茶和克拉东为例,探讨其药代动力学 NPDIs 的潜在机制。
Sep, 2022
本研究使用多视图图形自编码器模型和注意机制来整合多种药物特征,从而学习准确和可解释的药物相似性度量,实验证明模型能够显著提高预测准确性和模型容量。
Apr, 2018
本文综述了基于化学结构、网络、自然语言处理、混合方法的药物预测模型以及基于图神经网络模型表示分子结构的理论框架或深度和图学习方法的优缺点、潜在技术难点和未来发展方向。
Jun, 2023
癌症的复杂性和对治疗的不同反应使得基于组学序列分析的精准肿瘤学成为当前的标准。然而,每个患者产生的大量数据使得快速确定最佳治疗方案变得困难。为了改善对有效药物 - 细胞系对的学习能力,我们提出使用对比学习来改进药物和细胞系的表示,从而保留与药物作用机制和细胞系癌症类型相关的关系结构。除了相对于现有方法实现了更好的性能外,我们发现使用我们学习到的表示的分类器在进行预测时对药物和细胞系特征的依赖更加平衡。这有助于基于与药物耐药性相关的信号提供更个性化的药物优先级选择。
Oct, 2023