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antibody design
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大规模配对抗体语言模型
我们提出了 IgBert 和 IgT5，这两个迄今为止最好的抗体特异性语言模型，在设计更好的治疗方法方面，能持续处理成对和不成对的变量区域序列作为输入，并且在抗体工程的多样化设计和回归任务上，这些模型胜过了现有的抗体和蛋白质语言模型。这一进
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3 months ago
通过直接基于能量的偏好优化进行抗原特异性抗体设计
通过使用预先训练的条件扩散模型和等变神经网络，我们提出了直接基于能量偏好优化的方法来指导特定抗原的抗体生成，以获得具有合理结构和显著结合亲和力的抗体设计，实验证明了我们方法在优化抗体能量和提高结合亲和力方面的卓越性能。
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3 months ago
Anfinsen Goes Neural: 一种基于图模型的条件抗体设计
抗体设计，深度学习，蛋白质知识，Anfinsen Goes Neural, 现有技术
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5 months ago
ICLR
基于条件的抗体设计作为三维等变图形翻译
本文提出了多通道等变注意力网络（MEAN）用于抗体设计，通过导入目标抗原和抗体的轻链等组件，将抗体设计公式化为条件图转换问题，并采用 E (3)- 等变信息传递和建议的注意力机制来更好地捕捉不同组件之间的几何关系，最终通过多轮渐进式全射法输
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2 years ago
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