bioinformatics | BriefGPT - AI 论文速递

关键词bioinformatics

搜索结果 - 50

KMC 3: k-mer 统计及操作
介绍了 KMC2 算法的显著改进 ——KMC3 以及用于操作 k-mer 数据库的 KMC 工具，这些工具的有用性在一些真实问题上得到了验证。
PDF7 years ago
MM非负矩阵分解中贝叶斯泛化误差的上界
本文研究了非负矩阵分解的真实对数规范阈值，并在贝叶斯学习中给出了一种上界估计，结果表明如果应用贝叶斯学习，则可以使矩阵分解的泛化误差小于常规统计模型。
PDF8 years ago
使用深度学习改进模型质量评估的 ProQ3D
使用深度神经网络替换支持向量机可以显著地提高蛋白质质量评估的准确性。
PDF8 years ago
AAAIMUST-CNN: 基于序列的蛋白质结构预测的多层移动和拼接的深度卷积架构
该研究提出了一种基于深度学习技术的卷积神经网络结构 (MUST-CNN)，使用 Multilayer Shift-and-Stitch (MUST) 技术和高效卷积操作，可以更好地预测蛋白质属性，结果优于以往的研究成果。
PDF8 years ago
生物信息学中的深度学习
本文介绍了深度学习在生物信息学中的应用，并按生物信息学领域（组学，生物医学成像，生物医学信号处理）和深度学习架构（深度神经网络，卷积神经网络，循环神经网络，新兴架构）将其进行分类，同时讨论了深度学习在生物信息学中存在的理论和实际问题，并提
PDF8 years ago
使用长短期记忆网络进行蛋白质二级结构预测
本文提出了一种基于双向长短期记忆细胞（LSTM）的循环神经网络模型来预测蛋白质的二级结构，使用 CB513 数据集评估，结果显示在 8 个类别中具有更好的性能（0.674）比现有技术（0.664）好。
PDF10 years ago
一种加权互斥最大集覆盖问题的精确算法
本文介绍了一个时间复杂度为 $O^*(1.325^m)$ 的精确算法用于权重互斥最大集覆盖问题，该问题是 NP 难问题并来自从基因突变中识别信号通路的生物信息学问题，目前该问题使用启发式算法解决，无法保证解决方案的性能。通过提供一个相对高效
PDF10 years ago
生物信息学众包
本文介绍了如何理解和应用不同类型的众包系统，包括协作劳动、有目的性游戏、微任务市场和开放式竞赛，以及这些系统在生物信息学方面的成功案例和指南。
PDF11 years ago
二元回归树与随机森林中的变量重要性
我们研究了二进制回归树中变量重要性和成对变量关联的性质，将理论从单棵树自然地扩展到树的集合，适用于随机森林等方法，因为这对筛选高通量基因组数据等过滤变量具有实用价值，而关于这些重要性值的性质很少有理论存在。
PDF17 years ago
CARTwheels 算法：挖掘 Redescriptions 的交替算法
这篇论文介绍了一个基于分类树的算法，以及将其应用于一种新的数据挖掘任务 —— 重描述挖掘。该算法和任务在生物信息学等领域非常重要，可以帮助集成多种数据形式，将已获得的知识应用到其他数据集，并用于发现数据中隐蔽的、微妙的特征。论文分析了算法设
PDF21 years ago