molecular fingerprints | BriefGPT

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高效计算分子指纹的 Python 库
该研究论文介绍了一个高效的 Python 库，用于计算化学分子指纹，并提供了全面的接口，使用户能够轻松将该库整合到现有的机器学习工作流中，能够在大型数据集上使用并行计算，在合理的时间内执行诸如超参数调优等任务，同时证明了即使使用简单模型，通
PDF3 months ago
对手性敏感的分子性质预测的 SE (3)- 不变多参数持久同调
通过结合关于分子手性的 SE (3) 不变性和 Vietoris-Rips 持久同调，我们提出了一种用于生成分子指纹的新型计算方法。该方法在药物发现和材料科学中具有重要意义，能精确预测分子性质。我们通过应用 Vietoris-Rips 持久
PDF7 months ago
通过分子指纹组合进行 ADMET 性质预测
通过使用随机森林或支持向量机等与扩展连通性指纹 (ECFP) 相结合的方法，我们发现这些方法在预测小分子效能方面始终表现优于最近开发的方法。进一步研究回归算法和分子指纹发现，梯度提升决策树（尤其是 CatBoost），结合 ECFP、Ava
PDF9 months ago
SMILES Transformer: 面向低数据药物发现的预训练分子指纹
本文介绍了一种基于 SMILES Transformer 的分子指纹预测方法，该方法在虚拟筛选和其他药物发现任务中表现出优越性，在小数据集和复杂分析环境中表现良好。
PDF5 years ago
NIPSCheMixNet: 使用多种分子表征的混合 DNN 架构预测化学性质
本文提出了一种基于 SMILES 和分子指纹的混合特征的神经网络模型 CheMixNet，其用于预测化学物质的性质，与其他候选神经网络体系结构相比取得了更好的效果。
PDF6 years ago