基于排列的带干预因果推断算法

May, 2017

Permutation-based Causal Inference Algorithms with Interventions

Yuhao Wang, Liam Solus, Karren Dai Yang, Caroline Uhler

TL;DR本文提出了两种利用观测和介入数据学习基因调控网络的算法，并证明了这两种算法在符合无偏性假设的情况下均具有一致性保证。同时，这些算法具有非参数性质，适用于分析非高斯数据。本文还对这两种算法在模拟数据，蛋白质信号数据和单细胞基因表达数据上的性能进行了分析。

Abstract

Learning directed acyclic graphs using both observational and interventional data is now a fundamentally important problem due to recent technological developments in genomics that generate such single-cell gene expression data at a very large scale. In order to utilize this data for l

directed acyclic graphs observational data interventional data gene regulatory networks causal inference

发现论文，激发创造

干预下因果有向无环图等价类的特征和学习

该研究考虑在观测和干预数据都可用的情况下学习因果 DAG，并使用一种可证明的算法实现此目标。

Feb, 2018

基于贝叶斯的从未知一般干预中发现因果关系

学习因果有向无环图（DAG）的问题，使用观测和干预实验数据的组合进行研究，采用贝叶斯方法从一般干预中进行因果发现，通过图形特征化和兼容先验的贝叶斯推断保证不可区分结构的分数等价性，利用马尔可夫链蒙特卡洛（MCMC）拟合 DAG、干预目标和导致的父节点集合的后验分布，最后在模拟和真实蛋白质表达数据上评估了所提出的方法。

Dec, 2023

基于置换的因果结构学习（未知干预目标）

针对部分或完全未知的干预目标的混合观测和干预数据的因果 DAG 模型估计问题，本文提出一个算法来寻找干预马可夫等价类，此算法采用贪心策略在排列空间中搜索以最小化新的分数函数，同时该算法是无参数的，因此适用于非线性关系和非高斯分布的情况，性能表现已被验证。

Oct, 2019

适应性在线实验设计用于因果推断

在线学习中基于干预样本历史的分离图系统相匹配的追踪停止因果发现算法优于现有方法，通过较少的样本实现更高准确性的因果图学习。

May, 2024

干预与观测数据的联合：有向无环图的干预马尔可夫等价类估计

该研究提出了一种基于高斯似然框架的有向无环图模型，用于联合建模观察数据和干预数据，以及通过 BIC 准则对干预马尔可夫等价类进行一致性估计，从而改善了干预数据的部分可鉴别性，提供更紧密的因果效应推断。

Mar, 2013

干预数据的可微因果发现

本文提出了一种新的方法，基于神经网络和流形变换，使用干预数据来学习因果有向无环图，该方法在多种情况下表现出与现有技术相媲美的灵活性和可行性。

Jul, 2020

混合有向无环图中的干预因果发现

通过干预来学习混合因果模型中变量之间的因果关系是一项具有挑战性的任务，本文提出了匹配性的必要和充分条件以及一种自适应算法，用于学习混合因果模型中的所有真实边，具有最佳干预效果并在混合模型不包含循环关系时尺寸最小。

Jun, 2024

祖先因果推断

提出一种通过利用更粗粒度的原因信息表示来降低搜索空间的组合爆炸，从而极大地减少计算时间，并根据信心对原因预测进行评分的新方法，证明了方法的正确性和渐近一致性，并证明了该方法在合成数据上的优越性能，并将其应用于具有挑战性的蛋白数据集中。

Jun, 2016

非目标干预下的因果发现

该研究论文提出了一种基于随机干预的因果发现模型，通过最小化干预次数来解决因果发现问题，提供了多对数竞争比的近似算法，并给出了一些初步实验结果。

Feb, 2024

从单变量干预推导因果顺序：保证与算法

根据数据分布的实际假设，本研究引入了干预忠实度的概念以及一种用于推断因果关系的得分，同时提出了一种名为 Intersort 的算法，能够从包含大量单变量干预的数据集中近似地优化因果顺序，为进一步改进因果推断提供了重要的潜力。

May, 2024