Aug, 2019

BioFLAIR：用于生物医学序列标注任务的预训练聚合上下文化嵌入

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TL;DR研究比较 FLAIR 模型与其他模型（如 BERT）在生物医学命名实体识别任务中的表现，发现 FLAIR 在提供的 PubMed 向量上表现良好，甚至在某些任务上超越了 BERT，并且与其他模型叠加使用可以进一步提高结果。
发现论文，激发创造
  • 通过多粒度嵌入和增强标注进行多级生物医学命名实体识别

    本文提出了一种集成多种模型的混合方法，以解决生物医学实体识别中的局限性，并在 i2b2/2010 数据集上评估，得到了 90.11 的 F1 分数。

    Dec, 2023

  • 从语言模型中探测生物医学嵌入

    本文研究使用预训练的语言模型作为固定的特征提取器，并限制下游任务模型没有额外的序列建模层，探索在域内训练后的上下文词嵌入中携带的附加信息。结果发现，BioELMo 在编码实体类型和关系信息方面优于 BioBERT。

    Apr, 2019

  • 公开可用的临床 BERT 嵌入

    本文探讨了基于词汇的上下文嵌入模型在临床领域的应用，发现相对于通用语料库，专业领域语料库下的 BERT 模型在三个典型的临床自然语言处理任务上表现更加出色。

    Apr, 2019

  • 利用上下文嵌入增强临床概念抽取

    本研究旨在研究新的语言表示方法（如 ELMo，BERT）在医疗概念提取方面的应用，比较这些方法与传统词嵌入方法（word2vec，GloVe，fastText）的性能表现，并探讨将这些表示方法应用于医疗任务的可能性。研究结果表明，基于大型医学语料库的上下文嵌入方法表现出色，优于现有所有方法。此外，与传统词表示相比，上下文嵌入方法还包含有价值的语义信息。

    Feb, 2019

  • Med-BERT: 基于大规模结构化电子病历的预训练上下文化嵌入，用于疾病预测

    Med-BERT 是一种基于 BERT 框架训练的语境嵌入模型，适用于在数据集较小的情况下预测疾病。通过电子病历研究心力衰竭和胰腺癌的预测，表明 Med-BERT 具有较高的准确性和泛化性能，可以大幅提升深度学习模型的性能和推广医疗人工智能的发展。

    May, 2020

  • 医学术语嵌入的分层预训练

    这篇论文介绍了利用自然语言处理和表示学习生成医学术语的嵌入，以更好的预测临床决策和患者轨迹，提出了一个新的医学术语表示模型 HiPrBERT，并使用层次结构数据来训练和提高嵌入效果。

    Jul, 2023

  • 大规模生物医学命名实体识别

    通过在 Apache Spark 之上重新实现 Bi-LSTM-CNN-Char 深度学习架构，我们提出了一个单可训练的命名实体识别（NER）模型，该模型在七个公共生物医学基准测试中获得了新的最优结果，而不使用像 BERT 这样的重​​型上下文嵌入。该模型在生产级别代码库中作为开源 Spark NLP 库的一部分免费提供，并且可以扩展以支持其他人类语言，而不需要更改代码。

    Nov, 2020

  • FlairNLP 在 SemEval-2023 任务 6b 中的应用：利用上下文字符串嵌入从法律文本中提取法律命名实体

    本文介绍了利用命名实体提取技术和双向 LSTM 模型结合 Flair 嵌入对印度法院文本进行标注的实验，并公开了 BIO 格式的数据集。

    Jun, 2023

  • 基于 BERT 的生物医学实体标准化排名

    本研究中，我们提出了一种实体归一化架构，通过微调预训练的 BERT/BioBERT/ClinicalBERT 模型，并使用三种不同类型的数据集进行了广泛的实验，评估了预训练模型用于生物医学实体归一化的有效性。我们的实验结果表明，最佳微调模型始终优于以前的方法，并提高了生物医学实体规范化的最新水平，精确度提高了高达 1.17％。

    Aug, 2019

  • HunFlair: 一种易于使用的工具，用于现代生物医学命名实体识别

    提出了一种名为 HunFlair 的 NER 标记器，可覆盖多种实体类型，精度更高，并能处理文本体裁和风格的变化，HunFlair 在 Flair 框架中提供并兼容于各种操作系统中。

    Aug, 2020