CHAOS 挑战 -- 联合(CT-MR)健康腹部器官分割
深度学习在腹部多器官分割方面取得了巨大的进展,但在边缘情况和复杂器官上的鲁棒性仍然是一个具有挑战性的问题。为了调查模型的鲁棒性,我们收集并注释了 RAOS 数据集,包括 413 名患者的 413 个 CT 扫描,涵盖了诊断 / 放疗、部分切除和完全切除三个临床组。该数据集可以作为评估模型鲁棒性的潜在基准,并提供了一些在公共数据集中很难获取的器官。我们对几种最先进的方法在这三个临床组中进行了基准测试,评估了性能和鲁棒性,并评估了 RAOS 与三个公共数据集之间的交叉泛化能力。该数据集和综合分析为未来鲁棒性研究提供了一个潜在的基准。
Jun, 2024
利用 CT 标签地图生成合成图像,应用于腹部器官分割的 U-Net 网络训练,在 Dice 分数方面与在 MR 数据上训练的完全监督分割方法相比表现出类似的结果。
Mar, 2024
该论文介绍了一个大规模的腹部 CT 器官分割数据集 AbdomenCT-1K,其中包括来自 12 个医疗中心的 1000 多个 CT 扫描,并指出现有的分割方法在不同医疗中心、不同阶段和看不见的疾病上存在一定的局限性,提出了用于此类数据的四个器官分割基准以及针对这些基准的简单而有效的方法,这将有助于未来的医学影像研究。
Oct, 2020
应用基于转换器的模型进行训练,研究论文中介绍了在计算机断层扫描中腹部多器官分割的重要性以及深度学习方法在此方面的应用。尽管由于器官边界模糊、复杂的背景和不同器官尺度的挑战,单个网络精确分割不同器官仍然具有挑战性。先前的竞赛中基本上所有前五名的方法都使用了基于卷积神经网络的方法,与此相对,本研究中使用基于转换器的模型,并以竞赛中的大量样本为基础,展示了转换器模型在腹部多器官分割中的可行性及结果表现。
Sep, 2023
提出了一个能够在 MRI 扫描中进行多器官分割的深度学习模型,通过解决 MRI 分析中分辨率、标准化强度值和序列可变性的挑战,为当前的 MRI 分析限制提供了解决方案。
May, 2024
提出了一种名为 MRISegmentator 的 T1 加权腹部 MRI 序列的自动、准确和可靠的 62 个脏器和结构的分割工具,具有加速疾病诊断、放射治疗和异常检测等临床研究的潜力。
May, 2024
介绍了 AMOS 数据集,用于细分包含多个器官的腹部 CT/MRI 图像,并对该数据集上使用的多种深度学习模型进行了基准测试。
Jun, 2022
在这项研究中,我们提出了使用半监督学习和迭代伪标签策略来解决 FLARE23 挑战,在通过完整器官注释数据集训练的深度模型 (nn-UNet) 生成伪标签后,在 FLARE23 数据集上,我们的方法在器官分割和肿瘤分割上取得了优秀的结果。
Oct, 2023
提出了一种混合有导师的框架(StMt),通过使用部分标记和未标记的数据进行腹部器官和肿瘤的分割。采用两阶段分割流程和基于整体体积的输入策略,以最大程度地提高分割准确性,并同时满足推断时间和 GPU 内存使用的要求。在 FLARE2023 的验证集上的实验表明,我们的方法在分割性能、速度和资源利用方面都表现优异。平均 DSC 分数为 89.79% 和 45.55%,平均运行时间为 11.25 秒,GPU 内存 - 时间曲线下的面积为 9627.82MB。
Sep, 2023
定量器官评估是自动腹部疾病诊断和治疗规划的重要步骤。人工智能(AI)在自动化这一过程中显示出巨大的潜力。为了克服现有 AI 算法在现实世界多国家设置中对准确性和效率的大规模评估以及缺乏全面评估的限制,我们组织了迄今最大规模的腹部器官分析挑战 FLARE 2022 Challenge,旨在评估快速、低资源、准确、注释高效和泛化能力强的 AI 算法。我们从 50 多个医疗团体构建了一个跨洲际和跨国家的数据集,包括来自不同种族、疾病、阶段和制造商的计算机断层扫描(CT 扫描)。我们独立验证了一组 AI 算法通过使用 50 个标记扫描和 2000 个未标记扫描实现了 90.0% 的中位数 Dice 相似系数(DSC),这可以显著减少标注要求。最佳表现的算法成功泛化到保留的外部验证集,分别在北美、欧洲和亚洲队列上实现了中位数 DSC 分别为 89.5%、90.9% 和 88.3%。它们还实现了关键器官生物学特征的自动提取,这在传统的手动测量中需要耗费大量人力。这有望利用未标记数据提升性能并缓解现代 AI 模型的标注短缺问题。
Aug, 2023