Nov, 2023

基于深度学习的 H&E 乳腺癌全切片图像中与缺氧有关的形态特征检测

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TL;DR本研究展示了一种使用深度学习评估乳腺癌组织学形态学下低氧相关特征的新方法。通过对组织切片图像的训练和评估，我们证明了弱监督深度学习模型可以准确检测常规 H&E 全切片图像中的低氧相关特征，并展示了低氧和正常氧组织区域特征之间的显著差异。该方法具有潜在可将其扩展到其他肿瘤类型，并能轻松集成到病理工作流程中而不需要额外昂贵的化验分析。
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发现论文，激发创造
  • 通过对血红蛋白和嗜酸性染色组织学图像进行迁移学习改进乳腺癌诊断

    通过使用最新的 BRACS 组织学（H＆E 染色）图像数据集中的感兴趣区域（ROI）图像，我们使用不同的预训练深度学习模型，在处理图像时应用了数据增强、上采样和数据集拆分策略，最终达到了 96.2％的 f1-score，显著提高了乳腺癌肿瘤的早期诊断和鉴别，尤其是不典型和恶性肿瘤，从而改善患者预后并降低患者死亡率。

    Sep, 2023

  • 深度学习在乳腺癌组织学分类中的应用

    本研究利用深度学习方法，通过提取细胞核密度区域进行分类，通过 fine-tuning 原始的 Inception-v3 卷积神经网络，从而达到了对四种类型的 H&E 染色乳腺组织图像进行分类，并获得了高达 85% 的整体精确度和 93% 的癌症诊断精确度。

    Feb, 2018

  • DeepSMILE: 自监督异质感知多实例学习用于基于 H&E 全切片图像的 DNA 损伤响应缺陷分类

    提出了 DeepSMILE，一个深度学习弱标签学习方法，用于需要分析 Hematoxylin 和 Eosin 染色的肿瘤细胞的 WSI，无需像素级或瓦片级注释，使用自监督预训练和异质性感知的深度多实例学习进行学习，用于 HRD 和 MSI 预测，将其与最先进的基因组标签分类方法进行比较，DeepSMILE 在多中心乳腺和结直肠癌数据集中提高了 HRD 和 MSI 的分类性能。

    Jul, 2021

  • 乳腺组织病理学 H&E 全切片图像的公开数据集：系统综述

    通过对乳腺癌组织标本图像的数据集进行系统回顾，发现了 12 个公开的数据集，并对每个数据集的元数据和特征进行了报告，同时编制了一个文章中使用的补充资源列表。此外，还强调了建立乳腺癌 WSI 数据集元数据报告指南的必要性。

    Jun, 2023

  • 利用 H&E 染色组织图像预测早期乳腺癌复发风险

    通过分析病理学图像预测乳腺癌早期患者复发的风险，本研究探讨了深度学习算法是否能准确预测复发的可能性，结果显示通过对 125 个组织切片图像进行分析，得到了对低、中、高风险预测的灵敏度分别为 0.857、0.746 和 0.529，对应的特异性分别为 0.816、0.803 和 0.972，而与专家病理学家提供的组织级别信息对比，得到的皮尔逊相关系数为 0.61，此外，模型通过类活化图考虑了管状形成和有丝分裂率对不同风险组的预测结构。

    Jun, 2024

  • 利用基于深度学习的评估肿瘤相关基质来诊断组织病理学图像中的乳腺癌

    使用卷积神经网络分析乳腺癌患者的肿瘤相关基质来诊断，该系统在处理了 646 例乳腺组织活检标本后被证明具有较强的诊断能力，达到了 0.92 的 ROC 曲线下面积。

    Feb, 2017

  • 乳腺癌弱标签全切片图像的 PD-L1 分类

    本研究旨在基于 WSI 分析开发和比较能够根据 WSI 级别标签对乳腺癌样本的 PD-L1 阳性分类的模型，该任务包括 ROI 识别和将肿瘤分类为 PD-L1 阳性或阴性两个阶段，研究探讨了不同的特征提取方法和两个不同的训练配置，并测试了自动去除棕色伪迹的性能表现。

    Apr, 2024

  • 基于弱监督学习的病理切片整体分类

    该研究提出了一种基于病理先验的多实例学习框架，通过数据增强方法和空间相关性分析，能够有效地用于癌症检测和亚型区分的医学图像分类任务。

    Jul, 2023

  • 使用血红素和伊红素全切片图像的多实例学习用于胶质瘤诊断：一个印度队列研究

    该研究使用多个特征提取器和聚合器，通过对脑瘤组织病理学进行多实例学习实验，为精确诊断和个体化治疗策略提供了更新的性能基准，包括在印度人群中的新数据集 (IPD-Brain) 。利用经过组织病理学数据预训练的 ResNet-50 进行特征提取，并结合 DTFD 特征聚合器，该方法在三种脑胶质瘤亚型分类上分别在 IPD-Brain 和 TCGA-Brain 数据集上取得了 88.08 和 95.81 的 AUC 值。此外，该研究通过 H＆E 染色全切片图像在 IPD-Brain 数据集上建立了基于分级和检测 IHC 分子生物标记物（IDH1（突变 R132H），TP53，ATRX，Ki-67）的新基准，并突出了模型决策过程与病理学家诊断推理之间的显著相关性，强调了其模拟专业诊断程序的能力。

    Feb, 2024

  • 基于深度学习的乳腺癌肿瘤和免疫表型的组织病理预测

    通过应用多实例学习算法和不同的特征提取方法，该研究对乳腺癌的初级肿瘤进行多重描述，以测量肿瘤和免疫表型，为开发计算病理学标志物提供了潜力。

    Apr, 2024