Feb, 2024

整片切片图像的肿瘤分割：训练还是提示？

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TL;DR肿瘤分割是肿瘤诊断中的关键任务，本文研究了在组织学中应用全幻灯片图像进行肿瘤分割的深度学习方法，同时利用视觉提示的新范式在三个不同的器官中展示了与传统方法相比相当甚至更好的性能。
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发现论文，激发创造
  • 克服基于 Patch 学习的限制，用于识别全扫描切片图像中的癌症

    本文讨论如何将深度学习用于对大型 WSI 图像进行癌症检测， 比较分析基于图像块或幻灯片的分类与需要在整个幻灯片上准确定位或分割癌症的方法之间的差异，并提出一种负数据采样策略，可显着降低假阳性率，并在肿瘤范围的错误率上取得 15% 的减少。

    Dec, 2020

  • 使用小视觉提示进行单次和部分监督的细胞图像分割

    本文介绍了一种基于深度学习的微观细胞图像语义分割，提出了针对数据量少的高效学习框架，并提出了一次学习和部分监督学习这两种学习策略以及使用小提示图像的新型分割方法。实验结果证明，与传统方法相比，提出的方法提高了 Dice 系数 (DSC)。

    Apr, 2023

  • 利用语义分割的多阶段病理图像分类

    本论文提出了一种新的模型结构，将基于补丁的分类模型和整个切片比例的分割模型相结合，以提高自动病理诊断的预测性能，并通过优化方法，使模型部分地进行端到端学习，应用于 WSI 的肿瘤 / 正常预测，与传统基于补丁的方法相比，分类的性能得到了提高。

    Oct, 2019

  • 组织学肿瘤弱监督多实例学习分割

    本文提出了一种弱监督整个切片图像分割的框架，利用标准的临床注释，采用多实例学习方案进行模型训练，并在 The Cancer Genome Atlas 和 PatchCamelyon 数据集上进行了评估，显示出一定的潜力.

    Apr, 2020

  • 使用提示进行医学图像分割

    本文提出了一种利用图像级标签来促进分割的双 U 形两阶段框架，通过预训练分类网络获取层次金字塔特征并引导下游分支的学习，在像素级标签的监督学习下，通过短跳和长跳将从分类分支获得的层次特征输入到下游分支中，并得到病变掩模，实验证明我们的框架相比只使用像素级标注的网络取得了更好的结果。

    Jun, 2024

  • 基于 Patch 的卷积神经网络用于全切片组织图像分类

    通过训练决策融合模型以及利用 EM 方法自动定位有效的 Patch，可以实现对肿瘤亚型的分类，其分类精度与病理学家之间的一致性相似，这种基于 Patch 的 CNN 可以比基于图像的 CNN 更好地处理图像分类任务。

    Apr, 2015

  • 上下文感知自监督学习整张切片图像

    本文提出了一种通过将全切片图像 (WHIs) 表示为图来进行肿瘤诊断的方法，使用图卷积网络 (GCN) 捕获 WSI 中的上下文依赖关系，并使用自监督学习获取无标签数据的训练增强。这种方法利用节点表示 WSI 的 patch，是一种包含上下文信息的模型方案，相比于现有方法或基于多实例学习（MIL）的方案实现了性能的提升。

    Jun, 2023

  • 分类整张切片图像：什么是重要的？

    通过系统地研究 WSIs 分类算法的不同设计选择，我们发现全局上下文信息并非越多越好，而是以局部小区域的细节信息为主要特征，此外，相较于在更大的数据集上进行无监督预训练，我们发现在更小、更专注的数据集上进行预训练可以更好地区分输入补丁的微妙差异。

    Oct, 2023

  • 无监督互相转换器学习用于多千兆像素全切片图像分类

    提出一种基于相互 Transformer 学习的全无监督 WSI 分类算法，并在公开数据集上进行了广泛实验，证明了该方法在 WSI 分类和癌症亚型分类方面的优越性能。

    May, 2023

  • 自我监督学习全尺寸切片表示的框架

    自我监督整个切片学习（S3L）框架可以通过利用整个切片的固有区域异质性、组织学特征变异性和信息冗余性来学习高质量的整个切片表示，用于癌症诊断和基因突变预测等诊断任务，并且在两种生物医学显微镜条件下显著优于基线模型。

    Feb, 2024