Apr, 2024

具有本地域对齐的功能蛋白设计

TL;DR利用从蛋白质数据库中提取的文本注释进行生成以及多模态对齐,PAAG(Protein-Annotation Alignment Generation)是一个多模态蛋白质设计框架,可以显式地在序列空间中生成带有特定领域条件的蛋白质,并且可以设计具有不同类型注释的新型蛋白质。与现有模型相比,PAAG 的实验结果在 7 个预测任务中显示出对齐蛋白质表示的优越性,并且在生成成功率方面显著提高(锌指蛋白为 24.7%对比 4.7%,免疫球蛋白结构域为 54.3%对比 8.7%)。