NIPSOct, 2016
基于结构的虚拟筛选中相互作用预测的深度学习架构
Learning Deep Architectures for Interaction Prediction in Structure-based Virtual Screening
Adam Gonczarek, Jakub M. Tomczak, Szymon Zaręba, Joanna Kaczmar, Piotr Dąbrowski...
TL;DR介绍了一种基于深度学习的结构虚拟筛选算法,通过对每个化合物分别应用可学习原子卷积和 softmax 操作生成固定大小的蛋白质和小分子指纹。使用这些指纹进行内积计算来预测结合位点的亲和性,并且介绍了一种新的基准数据集 DUD-E 和 PDBBind 数据库。