本文从物理角度提供讨论了支配细胞迁移的相互作用机制，并对解释这些相互作用如何导致细胞运动的物理模型进行了综述，包括点阵模型、相场模型、活性网络模型、粒子模型和连续模型，并讨论了这些模型的局限性和主要涌现现象。

May, 2019

研究细胞分裂和凋亡对二维上皮组织中集体动力学的影响，发现存在丰富的非平衡相图，而且该组织会因内部活动而自行熔化，排除了任何玻璃相的存在。

Oct, 2016

利用无监督聚类和稀疏度推导算法的组合，学习解释自组织活性粒子系统中的宏观模式形成的局部主导力平衡，揭示了该系统中的自组织结构形成的物理机制。

Jul, 2023

本文研究了非平衡态下存在的集体系统，详细探讨了个体材料组分内部能量以及小扰动对整个系统流变性质的全球影响，利用模拟推断方法依据少量图像数据提取了集体系统参数的可行性，着重强调了复杂集体系统内部的结构关系是生成模型和数据更精确匹配的重要因素。

Apr, 2023

本文介绍了各种建模方法和数值技巧，以阐明理解主动物质的创新和当前挑战。本文还认为微观细节通常是相关且强烈影响集体行为的，这意味着选择适当的建模水平是一个微妙的选择。最终，我们将讨论进一步改进现有模型和技术以应对复杂环境和生物环境的当前方法。

Oct, 2019

本文回顾了近期将非平衡统计力学和流体力学原理应用于形成一种系统化的理论，以研究仅涉及微观细节的集合活性粒子（活性物质）行为的进展，同时并列讨论了实验和理论，提出了一种统一的观点，其中包括不仅仅是生物系统，还有无生命的类比。

Apr, 2010

提出了一种基于深度学习的细胞轮廓跟踪方法，使用无监督学习实现了机械和周期性一致性损失函数来训练轮廓跟踪器，对相位对比和共聚焦荧光显微镜拍摄的两个数据集进行了稀疏跟踪点标记以得到定量评估结果，其轮廓跟踪器比其他方法表现更好且产生更优质的结果。

Mar, 2023

本文提出一个含满足排斥统计性和并行动力学的 vmax=1 模型的二维元胞自动机模型，使用全向场模拟交通流，该场受扩散、衰减和行人影响，可描述行人的集体效应和自组织行为，并应用于疏散的模拟。

Feb, 2001

本文提出了一种基于分子流体的 Voronoi 镶嵌概念的流体粒子动力学机制模型，并推导出具有剪切力的耗散粒子动力学算法，该算法结构类似于标准的平滑粒子动力学算法，并可一般化热力学涨落、精确角动量守恒等；最后，对耗散粒子的动力学理论进行了推导，以参数化的形式提出了流体运输系数的显式表达式。

Sep, 1997

研究不规则系统中微观配位引起的刚性特征，通过推导理论和模拟验证表明该系统在贴近堵塞阈值时出现失配的临界行为并对玻璃转变和随机紧堆积的几何形态等具有重要理论意义.

Dec, 2005