Sep, 2023

AI-Aristotle:物理启发式框架用于生物系统灰盒识别

TL;DR我们提出了一种新的物理知识 - 感知框架,用于系统生物学领域中的参数估计和缺失物理识别 (gray-box identification),该框架将 eXtreme Theory of Functional Connections (X-TFC) 的域分解和 Physics-Informed Neural Networks (PINNs) 与符号回归 (Symbolic Regression) 技术相结合,以实现参数发现和灰盒识别。通过在两个系统生物学基准问题上进行测试,我们证实了 AI-Aristotle 方法的准确性、速度、灵活性和稳健性,这两个问题分别是药物吸收动力学模型和葡萄糖胰岛素相互作用的超活动内分泌模型。本研究的主要贡献在于通过合成数据验证了 AI-Aristotle 的性能,但其同样可以处理带有噪声的实验数据,并且甚至可以在笔记本上仅用几分钟进行黑盒识别。此外,我们还提供了将神经网络与符号回归器集成的精确性、成本、可扩展性和稳健性方面的见解,为研究人员在生物医学领域及其他复杂动态系统中解决灰盒识别挑战提供了全面指南。